海运货物运费的计算较为复杂，主要根据货物的重量或体积（取两者中较大值，即 “择大计收”）以及运输航线等因素确定。首先，船公司会根据不同航线制定基本运费率。基本运费率通常以每运费吨（重量吨或尺码吨）为单位。重量吨是指货物毛重达到 1 吨，尺码吨是指货物体积达到 1 立方米，1 重量吨和 1 尺码吨统称为 1 运费吨。
例如，某批货物毛重为 5 吨，体积为 8 立方米，从上海运往纽约。假设该航线基本运费率为每运费吨 200 美元，由于体积 8 立方米大于重量 5 吨，所以按照体积 8 立方米计算运费。则基本运费为 8×200 = 1600 美元。
除了基本运费，还可能会有各种附加费。常见的附加费有燃油附加费，这是由于燃油价格波动，船公司为弥补成本增加而收取的费用，一般以基本运费的一定百分比计算。比如燃油附加费费率为 10%，则燃油附加费为 1600×10% = 160 美元。
还有港口附加费，不同港口可能会因为自身运营成本、设施条件等因素收取港口附加费。例如某港口收取每吨 50 美元的港口附加费，该批货物按 8 运费吨计算，港口附加费为 8×50 = 400 美元。
如果货物超重或超长等，还可能会有超重附加费、超长附加费等。将基本运费与各项附加费相加，就是这批货物的总运费。在实际计算中，海运代理要准确掌握船公司的运费计算规则和各种附加费的收取标准，根据货物的详细信息，为货主计算海运运费，并向货主清晰解释费用构成。 
